分享几个基因组研究sci论文能用到的数据库

　　分享几个基因组研究sci论文能用到的数据库。当我们在撰写论文的红寺湖往往都需要使用一些数据库，通过数据库可搜索到自己所写论文需要的资料，从而据此做一些相关研究。那么有哪些数据库是可以在我们撰写基因组研究的sci论文的时候能够用到的呢?下面艾思科蓝小编来跟大家介绍一下。

　　1、ICGC(InternationalCancerGenomeConsortium)数据库通过数据库可搜索到自己感兴趣的基因在患者样本中的突变情况，还会提供基因的基本信息和一些注释，包括该基因参与的通路以及相应的GO注释等。最重要的是该数据库可以查看在某种癌症中基因突变的排名情况，从而据此做一些相关研究。网址https://dcc.icgc.org/

　　2、COSMIC(CatalogueOfSomaticMutationsInCancer)提供了与癌症相关体细胞突变的信息，记录的体细胞突变比较详细，可以追溯到文献出处，还能将样本信息、涉及的癌症类型等进行统计。COSMIC不仅可以知道一个基因突变的较详细的信息，还可以统计某一肿瘤组织的所有突变信息。网址https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/

　　3、DAVID(TheDatabaseforAnnotation，VisualizationandIntegratedDiscovery)主要进行基因功能和通路注释等功能分析，包括功能注释、基因功能分类、基因ID转换等。将感兴趣的基因关联到生物学注释上，利用统计学的方法，在数据库中的关联注释中获取最显著富集的生物学注释，从而筛选该基因的生物学功能。该数据库提供了一种快速的方法，将大量的基因列表缩减为功能相关的基因组信息，以帮助筛选高通量技术获得的生物信息。网址https://david.ncifcrf.gov/

　　4、GeneCards整合了几大类数据库对于基因的分析数据，包括基因组、转录组、蛋白质组、遗传、临床和功能信息，在里面可以找到所感兴趣基因的全面功能信息，包括基因突变信息、表达、功能以及蛋白互作等，还包括各种数据库的相互转换。网址https://www.genecards.org/

　　5、微阵列芯片技术的发展促使了基因芯片的广泛应用，这之中产生了海量的数据资源，为基因的研究提供了有利的条件，为了便于储存及处理这些数据，美国国立卫生研究院旗下的美国国立生物技术信息中心(NCBI)创建了基因表达数据库(GeneExpressionOmnibus，GEO)。GEO也是当今最大、最全面的公共基因表达数据库之一。网址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

　　6、TCGA(TheCancerGenomeAtlas)是由美国国立卫生研究院国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所共同合作的一个项目，旨在通过基因手段全面表征预后不良，解析癌症发生的分子互作、肿瘤的亚型和治疗的靶点等。TCGA数据库如今已经完成了对11000例病人的33种肿瘤的7个不同层面的数据进行分析，同时可以搜索基因的信息、突变频率、突变位点分布等，是一个功能较强大的数据库，可谓是癌症研究的必备工具。网址https://cancergenome.nih.gov/

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