个人简介

王理（智慧医疗PI） 学科专业：生物医学信息学 实验室位置：南通产业研究院4号楼9楼 学习经历： 1999-09~2003-06南京师范大学学士，教育技术 2003-09~2006-06南京师范大学硕士，教育技术 2008-04~2011-03日本德岛大学博士，智能信息系统工程（自然语言处理） 主要工作经历与任职情况： 2019.8-至今，南通大学，智能信息技术中心智慧医疗方向PI 2012.8-2019.7南通大学,医学院医学信息学系,副教授 2018.6-2019.7南京医科大学，生物医学工程与信息学院医学信息工程系，特聘教授 2016.8-2017.2美国德克萨斯大学休斯顿健康科学中心,生物信息学院，高级访问学者 2012.6-2014.6南通大学附属医院南京医科大学，博士后 2011.6-2012.7南通大学,医学院医学信息学系，讲师 2006.7-2007.12江苏工程职业技术学院，信息系，讲师 主要研究领域及兴趣： 日本德岛大学智能信息系统自然语言处理方向博士，中国南京医科大学博士后，美国德州大学高级访问学者。目前南通大学副教授，南京医科大学特聘教授。目前是以医学自然语言处理为主题，在医学信息学顶级期刊JAMIA发表论文，并且获得国家自然科学基金面上项目(81873915)与科技部重点研发计划子课题资助(2018YFC0116902)的唯一科学家。 由于国内公共医疗管理系统的不完善，医疗成本高、渠道少、覆盖面低等问题困扰着大众民生。尤其以“效率较低的医疗体系、质量欠佳的医疗服务、看病难且贵的就医现状”为代表的医疗问题为社会关注的主要焦点。大医院人满为患，社区医院无人问津，病人就诊手续繁琐等等问题都是由于医疗信息不畅，医疗资源两极化，医疗监督机制不全等原因导致，这些问题已经成为影响社会和谐发展的重要因素。所以我们需要建立一套智慧的医疗信息网络平台体系，使患者用较短的等疗时间、支付基本的医疗费用，就可以享受安全、便利、优质的诊疗服务。从根本上解决“看病难、看病贵”等问题，真正做到“人人健康，健康人人”。 主要的工作包含： （1）借鉴国内外优秀的临床术语与词表系统，将通用的临床指南转化为知识库，通过知识集成引擎建立以相似病例模型为核心的多种疾病领域的临床决策支持知识图谱，利用知识图谱等技术手段将现有领域知识同医疗数据有机融合，有助于发挥人工智能和医疗大数据的实际作用，从而在疾病的预防、诊断和治疗等多个环节提供更好的医疗服务。本项目通过面向医院信息系统、电子病历、健康档案等大数据的知识图谱构建，针对医疗领域大数据异构复杂、知识抽取和多源融合困难等问题，通过结构创新和技术创新，利用实体间关系抽取、多源知识关联、知识图谱自学习和基于实际临床数据分析的动态知识更新等方法，实现基于知识图谱的临床辅助决策应用途径，符合指南要求。 （2）基于人工智能的临床辅助决策支持新型服务模式，是在人工服务的基础上，依赖于对各类数据进行搜集、整理、分析、处理后所产生的新的服务方向、服务目标而形成的“新型”模式，该模式的核心在于利用人工智能对搜集到的数据所进行的分析方法及其分析的结果。而人工智能的核心是机器学习算法，对于各类临床数据如检验数据、基因数据、病历数据、影像数据、病理数据等，传统的普适性算法无法针对临床的实际需要产出相应的价值。因此，本课题根据当前现状，提出支撑临床辅助决策专家系统的方法研发，重点就在于以临床需求、专家经验、客观事实为导向和依据，将需求与机器学习方法相结合，通过多种方法的融合创新，研发能够作为“新一代人工智能技术与临床辅助决策专家系统”的核心数据分析方法，以实现对本项目决策系统的坚实支撑 （3）通过搭建基于人工智能算法的临床决策支持云平台，与医院电子病历系统进行有机整合，实现辅助分诊、辅助问诊、辅助诊断和辅助治疗的全方位临床决策支持。所实施的系统通过与HIS、CIS、LIS、PACS、EMR等信息系统的整合，有机融入现有的医院电子化诊疗流程，符合指南“面向医院信息系统、电子病历、健康档案等大数据”的要求；项目通过搭建全方位涵盖分诊、问诊、诊断、治疗的临床医疗辅助支持云平台，实现指南中“覆盖全就医闭环流程的新型服务模式解决方案”的目标。 （4）基于人工智能的临床辅助决策支持新型服务模式，依赖于医院信息系统、电子病历、健康档案等组成的大数据，首先应实现指南中“自动获取相关信息、智能提取分析数据”。但在对大数据进行数据挖掘以及智能算法的研发时，数据预处理是目前的必要步骤，包括数据清洗、数据整理等，其原因就在于不同来源的电子病历等数据其格式标准均不统一，对数据在服务模式中不同模块间的流转造成了阻碍，“形成规范电子病历和报告”并“确保所有数据真实可靠和保护隐私”是实现项目指南目标的基础。另一方面，新型服务模式的主要目标是实际患者，在与患者进行交互的过程中，诊断报告是其中的关键部分，能够向患者以较为量化的形式展示其当前的健康状况，但在我国当前医疗环境下，完全由医生撰写诊断报告并不现实，本课题所研究的报告自动生成是解决当前医疗问题，实现新型服务模式落地的重要部分。 （5）基于人工智能的临床辅助决策支持新型服务模式，最终的目标在于“临床”与“服务”，通过本项目所研发的系统，为现行临床服务流程加入创新性的改进与优化，从而提升服务质量，是本项目要解决的重要实际问题。因此，将本项目所研发的临床辅助决策专家系统进行临床验证与推广，是在指南要求下所必须要完成的任务之一。通过在二级医院、三级医院进行系统的部署与临床验证，搜集5000例以上的患者数据以实现对系统的测试以及该新型服务模式的验证，开展成本效益分析、管理模型建立等，找出有待改进的部分，提高服务模式的完整程度，并最终在多家大型综合性医院推广临床辅助决策专家系统。 苏州赫博特医疗信息科技有限公司，临床电子病历中命名实体的抽取技术改进，2017/10-2018/10 参与开发Plato医学自然语言处理平台，实现将电子病例中大量存在的由自由文本描述的主诉、既往史、现病史、检验、检查、入院记录、出院小结、病程等非结构化信息，转化成统一化、规范化、结构化编码的数据，并且对接到OMOP临床科研通用数据模型，解决非结构化数据转化为标准的结构化数据难题，打破文本数据和临床科研分析之间的屏障。目前，平台中包含多种赫博特拥有完全自主知识产权的自然语言处理技术和功能模块，使用者可以根据文本的类型自由配置我们提供的算法来生成各种管道模型，能快速的实现文本的精准提取，准确率可达到90%以上。 神州数码医疗科技股份有限公司，肿瘤大数据处理分析与应用，2017/12-2018/11 收集肺癌、食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌等8种常见等恶性肿瘤的临床电子病历文本，结合病理科和检验科以及医嘱文本，建设标准化和可共享的病历文本集成平台；利用自然语言处理和电子病历信息抽取等关键技术进行大规模数据抽取。实现肿瘤大数据高性能处理分析与具体应用。 整合SNOMETCT，CHPO，LOINC等多个术语系统，开发针对肺癌、食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌等8种常见等恶性肿瘤的专用术语体系，协助进行电子病例的结构化和数据提取。对癌症知识，采用本体技术进行研究和分析，构建癌症本体模型。协助建立肿瘤医疗随访平台，临床决策支持平台。优化肿瘤精准医学大数据存储技术及传输安全性。 主持或参加纵向项目（课题）及人才计划项目情况 国家自然科学基金，面上项目(81873915)，面向信息交互的中国临床标准药物知识库构建与评测研究，2018-2022，主持 为了使得不同系统之间能够有效地无歧义地交换药品相关信息，项目通过借鉴国外成熟的药物信息模型，针对中国临床药物的描述特点，构建中国临床标准药物知识库。研究从四大数据源搜集药物的基本信息，然后将自然语言处理技术和领域专家审查相结合，实现药物属性提取，标准化，生成不同规格级别的药物名称描述，从多角度多层次构成药物知识库。目前药物知识库包含19,639种临床药物，250,267条药物概念以及2,602,760条药物关系。我们将药物知识库应用于江苏省人民医院院内药品与药物知识库进行映射、转换成通用数据模型中标准概念，用于后期药物统计与数据挖掘。实验结果表明，药物知识库可以准确描述规范化的药物信息，覆盖大部分药物资源，展示其促进中国各种电子病历系统之间药物信息互操作性的能力。 科技部国家重点研发计划，基于人工智能的临床辅助决策支持新型服务模式解决方案(2018YFC0116902)，在研,2018-2020，子课题负责人 建立临床文本中辅助决策支持概念的标准化映射，将临床指南转化为临床知识库体系；基于多种决策支持模型的新一代人工智能技术实现，搭建满足就医闭环流程需求临床辅助决策专家系统大数据云技术平台。研究临床医学文本的存储、管理与分析智能化流程，尤其是解决实现多中心临床数据的高速传输、云端管理与分析完整流程；在统一数据标准化框架下，开发临床辅助决策专家系统；研发新一代人工智能计算框架、算法与模型，实现知识的排列，索引与展现；分析满足智能辅助分诊、问诊、诊断和治疗的多致病性因素的分布规律。 代表性研究成果和学术奖励 (1)王理(3/8),新型癌胚型特异标志和HBV变异对肝癌监测和早期预警价值,中华预防医学会，中华预防医学会科学技术奖三等奖,科技进步,其他,2017.11 (姚登福;曹广文;王理;张津玮;陈建荣;姚敏;董志珍;吴玮)(科研奖励) (2)王理(2/7),肝癌分泌型聚集素异常表达及其靶向干预的临床价值,南通市人民政府，南通市科学技术进步奖三等奖,科技进步,其他,2017.5 (郑文杰;王理;陈飞;赛文莉;钱琦;姚登福;张海健)(科研奖励) (3)王理(4/5),流感病毒感染诱发多脏器损伤及线粒体能量代谢障碍机制,江苏省教育厅，江苏省教育科学研究成果(高校科学技术研究类)科技进步奖二等奖,科技进步,其他,201(姚登兵;姚敏;蔡敏;王理;姚登福)(科研奖励) (4)王理(4/7),HBV相关肝癌发病机制及特异分子监测技术研发与应用,江苏省人民政府，江苏省科学技术奖三等奖,科技进步,其他,2015 (姚登福;曹广文;王进科;王理;张津玮;姚敏;朱建伟)(科研奖励) (5)王理(2/7),肝癌IGF-I受体异常表达及其转录干预的临床价值研究,南通市人民政府，南通市科学技术进步奖二等奖,科技进步,其他,2015.12.21 (董志珍;王理;姚登福;李敏;姚宁华;严晓娣;吴玮)(科研奖励) (6)王理(4/9),肝细胞恶性转化特异标志筛选及早期预警价值研究,江苏省预防医学会，江苏预防医学科技奖一等奖,科技进步,其他,2015.2.27 (姚登福;王进科;龚伟达;王理;张津玮;顾红兵;徐水珠;朱建伟;陈钟) (7)王理，姜磊，黄勋，一种基于神经网络语言模型的药物潜在不良反应发现方法2019.05.23,201910039475.4实审（专利） (8)王理，姜磊，黄勋，一种基于注意力机制的医疗实体向量转化方法，2019.07.17,201910644003.1实审（专利） (9)王理;邵劲松;蓝俊;施维;薛均;张远鹏;董建成;姚敏;姚登福,一种突发公共卫生事件互联网文本抽取方法,2015.12.23,中国,CN201510964759.6(专利) (10)王理;蓝俊;邵劲松;施维;薛均;张远鹏;董建成;姚敏;姚登福,一种公共卫生事件预警知识库的构建方法,2015.12.22,中国,CN201510961363.6(专利) (11)王理;张远鹏;钱旦敏;董建成;姚敏;邵劲松;蓝俊,一种领域知识库属性扩展的方法,2015.1.8,中国,CN201510010013.1(专利，已授权) (12)王理;张远鹏;钱旦敏;姚敏;邵劲松;蓝俊;董建成,一种公共卫生突发事件领域知识库的构方 法,2015.1.8,中国,CN201510009769.4(专利) 招生招聘： 本实验室主要利用自然语言处理技术，机器学习和深度学习等手段，研究基于临床数据的疾病决策支持系统，应用于医院数据管理，医生辅助诊断以及智慧医疗健康系统。热情欢迎对智慧医疗有兴趣的学生加入。每年拟接收10名本科生，8名硕士生，4名博士生和2名博士后。