个人简述:
单细胞组学技术创新及其在基础理论和临床实践应用研究1.单细胞分析核心技术的下一代创新,特别重视单细胞表观组分析技术、多组学技术及高通量实用技术研发,并开展多领域的基础和应用研究。目前已经有Fluidigm C1、10X genomics、ddSEQ等平台。2.在单细胞水平上研究人类胚胎早期发育不同阶段的细胞组成、多组学特征、时空定位及发育轨迹、分子调控等,与国际上的人体细胞地图计划(Human Cell Atlas)相接轨,目的是在单细胞水平及组学水平研究正常及重大疾病相关的组织器官发育时空调控机制;3.基于单细胞技术的干细胞休眠和癌症分子机制及精准防治研究,重点聚焦于干细胞休眠及其调控,干细胞在癌症发生、发展及治疗抵抗中的作用和机制,癌症的个体内细胞异质性和细胞进化和分子进化机制等,重点是血液系统癌症;4.基于单细胞技术的生殖健康和液体活检应用研究,开展优生优育理论和应用研究,如无创产前诊断筛查(NIPD)、植入前胚胎的遗传检测(PGDPGS)新技术研究;也开展基于稀有细胞如(CTC)和血液无细胞DNA(cfDNA或ctDNA)开展癌症临床应用技术研究;5.组学大数据的生物信息学平台建设和研究,包括建立可靠的单细胞测序数据分析实用流程,并创建多维数据新数学算法和模型。作为单细胞组学技术领域最早期的开拓性研究者之一,我们以往的研究对单细胞测序领域的发展起了推动作用。共发表研究论文90多篇,具有多项自主知识产权专利。多次在美国等国际专业学术会议上发表大会报告、主持及组织会议,担任本行国际知名杂志编委、主编或外审专家(如Nature Protocols)等,评审英国医学研究会、比利时癌症基金会研究基金项目。
科研工作:
1. Pan X, Wu S, Weissman S. Single Cell Genomics: Technology and Application (Research Topic and e-book, partially published as paper in Frontiers series of journals), invited by Frontiers. http:journal.frontiersin.orgresearchtopic4004single-cell-genomics-technology-and-application2. Pan X, Urban AE and Weissman SM. Chapter 20: Enriching DNA sequencing with nucleotide variation by thymidine glycosylase combined with suppression PCR. In: PCR Technology: Current Innovations (3rd Edition), edited by Tania Nolan and Stephen A. Bustin, CRC Press. June 17, 2013. pp. 285-297 (total 475 pages). ISBN 9781439848050.