个人简述:

生物图像信息学（Bioimage Informatics）是一门以生物图像作为数据源、以计算科学作为工具来解决生物学问题的交叉学科，是当今发展最迅速的新兴学科之一，其中所涉及的知识包括生物医学、图像处理、模式识别等多个方面。在数据方面，常用的图像有细胞或组织的显微图像、CT、磁共振图像（MRI）等，这些数据除了可以从生物实验室或医院获取外，目前已有多个大型且免费公开的图像数据库可供下载研究，如已发展十余年较为成熟丰富的人类蛋白图库（Human Protein Atlas）、2016年底启动的人类细胞图库（Human Cell Atlas）项目等，为生物图像信息学的发展提供了大数据支持。在算法方面，针对不同问题的特点已有多种图像处理和机器学习分类算法被用在该学科中，包括图像分割、图像校准、纹理和形态特征提取、人工神经网络、支持向量机等。目前国际上有很多研究组都致力于推动生物图像信息学的发展，也取得了不少成就，如美国卡内基梅隆大学的Robert F. Murphy研究组（http:murphylab.web.cmu.edu）、美国艾伦脑科学研究院的Hanchuan Peng研究组（http:home.penglab.com）、国内上海交通大学的沈红斌研究组（http:www.csbio.sjtu.edu.cn）等。